Le chlorure de méthane-sulfonyle est utilisé comme intermédiaire de la gemcitabine.
La gemcitabine est un analogue nucléotidique de la pyrimidine, qui fait partie des anticancéreux anti-métaboliques.Il peut empêcher la progression de la synthèse d'ADN pendant une certaine période, c'est-à-dire la phase S.Il a les caractéristiques d'un large spectre anticancéreux, d'un mécanisme d'action unique, d'une faible toxicité, d'aucune résistance croisée avec d'autres médicaments chimiothérapeutiques et d'aucune superposition de toxicité.Aujourd'hui, l'utilisation de la gemcitabine a été approuvée dans plus de 90 pays, devenant le médicament de première ligne pour le traitement du cancer du poumon non à petites cellules et le « gold standard » pour le traitement du cancer du pancréas.